Создан по приказу Минобразования РФ № 17-В от 18 января 2002 г., полномочия продлены приказом № 713-В от 21 марта 2003 г.

Деятельность совета возобновлена приказом Рособрнадзора № 2249-1499 от 02.11.2007 г.

За время работы совета защищено 23 кандидатских и 4 докторских диссертация, в том числе 6 по специальности 13.00.02 (математика), 4 по специальности 13.00.02 (химия), 17 по специальности 13.00.08.